Juillet 1988. L’utilisation d’une nouvelle arme de destruction massive dans la région du Kantō, au Japon, déclenche la Troisième Guerre mondiale. 2019, trente et un ans plus tard. Alors que les préparatifs des Jeux olympiques de l’année suivante ravivent le souvenir de la grandeur passée de Neo-Tokyo, mégalopole bâtie sur la baie de Tokyo, Kaneda, chef d’un gang de bōsōzoku justiciers, sillonne à moto les rues dévastées de la ville et sème le chaos. Une nuit, Tetsuo, membre du gang, croise la route d’un étrange garçon lié à un programme expérimental du gouvernement. Sous les yeux médusés de Kaneda et de sa bande, Tetsuo et le mystérieux garçon sont emmenés dans un laboratoire militaire. Déterminé à sauver son ami, Kaneda s’infiltre dans l’installation, où il découvre que Tetsuo a développé des pouvoirs surnaturels. Pendant ce temps, l’un des enfants du laboratoire prédit le réveil d’AKIRA, le secret le mieux gardé du gouvernement. En quête de réponses sur ses nouveaux pouvoirs, Tetsuo descend dans les profondeurs de Neo-Tokyo, où AKIRA est endormi depuis des années.